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Este artigo apresenta o modelo DDGeoSSE, uma abordagem generativa baseada em eventos que utiliza aprendizado profundo para inferir como a riqueza local de espécies modula as taxas de especiação, extinção e dispersão, demonstrando empiricamente que a diversidade local influencia significativamente a dinâmica de diversificação em lagartos *Anolis* das Antilhas e plantas do gênero *Viburnum*.
Este estudo demonstra que a duplicação do genoma específica dos teleósteos, ocorrida há cerca de 300 milhões de anos, gerou uma redundância prolongada nos genes *omp* e em outros componentes da cascata de sinalização olfativa, a qual, ao ser moldada por restrições de dosagem gênica, permitiu a diversificação funcional e molecular do sistema olfativo desses peixes.
Este estudo apresenta um método inovador de paleoproteômica direcionada de alto rendimento, utilizando espectrometria de massa MALDI-CASI-FTICR, que permite a estimativa rápida e precisa do sexo biológico em restos arqueológicos medievais da Grande Morávia, superando as limitações de técnicas osteomorfológicas tradicionais.
Este estudo analisa 33 trios de pais e filhos de corujas-do-barn (Tyto alba) para determinar que a espécie possui uma taxa de mutação de 5,6 x 10⁻⁹, onde os pais transmitem o dobro de mutações que as mães e o número de mutações aumenta com a idade paterna, fornecendo evidências diretas de senescência germinativa em aves.
Este estudo demonstra que a seleção dependente de frequência negativa mantém a variação na qualidade dos parceiros na mutualismo entre leguminosas e rizóbios, favorecendo linhagens de alta qualidade quando raras e preservando a diversidade genética essencial para a resiliência evolutiva, mesmo sob diferentes condições ambientais.
Este estudo demonstra que, para inferir o tempo de fixação de varreduras seletivas duras em dados genotípicos de uma única população, os modelos de aprendizado de máquina que utilizam dados brutos não superam os métodos baseados em estatísticas resumo convencionais, sugerindo que poucos sinais não descobertos permanecem para distinguir esses parâmetros.
Este artigo apresenta um modelo analítico de duas escalas temporais que demonstra como os Elementos Retrotranscritos Geradores de Diversidade (DGRs) conferem uma vantagem evolutiva em ambientes variáveis, superando a mutagênese padrão ao permitir uma rápida diversificação de regiões gênicas específicas para adaptação a mudanças ambientais.
Este estudo reavalia a evolução do número de cópias do gene AMY1, demonstrando que a variação observada é impulsionada principalmente pela história demográfica e ancestralidade compartilhada, e não pela adaptação a dietas ricas em amido, desafiando assim a hipótese agrícola tradicional.
Este estudo caracteriza a levedura *Kluyveromyces marxianus* como um modelo de tolerância a extremos, revelando que sua resistência a altas temperaturas e estresses químicos resulta de adaptações evolutivas de milhões de anos que envolvem expansões gênicas, variantes adaptativas em transportadores de membrana e alterações no processamento de lipídios.
Este estudo reavalia a evidência de codiversificação em simbioses micorrízicas, demonstrando que, embora exista um sinal cofilogenético significativo (onde plantas e fungos relacionados interagem), não há congruência filogenética, indicando que a evolução desses sistemas é impulsionada por coevolução difusa e compatibilidade de traços, e não por codiversificação direta.
Este estudo demonstra que gargalos funcionais em paisagens de aptidão proteica podem emergir de um modelo simples de epistasia global com traços aditivos subjacentes, sem a necessidade de redes complexas de interações, desde que haja um equilíbrio adequado entre mutações neutras e não neutras.
Este estudo apresenta um modelo analítico geral que deriva expectativas teóricas para a acumulação de junções de ancestralidade em genomas de populações misturadas, demonstrando que a contagem de comutadores de ancestralidade é robusta e alinhada com simulações e dados empíricos, permitindo assim compreender como a recombinação e a demografia moldam conjuntamente os padrões de ancestralidade sem a necessidade de separar as fontes parentais.
Este estudo investiga a evolução específica de linhagem das paisagens regulatórias no amendoim poliploide e seus progenitores diploides, revelando que, embora a maioria das regiões de cromatina acessível (ACRs) mantenha estabilidade após a poliploidização, um subconjunto surge *de novo* ou através de mutações, contribuindo para a expressão enviesada de homeólogos e demonstrando que variações sutis na sequência e composição de sequências não codificantes conservadas (CNSs) podem levar a alterações significativas na acessibilidade da cromatina.
Este estudo identifica nove inversões cromossômicas putativas em populações selvagens do ouriço-do-mar-roxo (*Strongylocentrotus purpuratus*), das quais três apresentam sinais de seleção local e enriquecimento funcional em vias de biomineralização e desenvolvimento, demonstrando o papel fundamental das variantes estruturais na adaptação local de espécies marinhas com alto fluxo gênico.
Um estudo de 47 anos com chapins-reais em Wytham Woods revela que o declínio a longo prazo na massa corporal adulta é impulsionado por efeitos de arrasto do ambiente precoce, especificamente a competição intra e interespecífica durante o desenvolvimento, e não por mudanças na temperatura ou no descompasso com a disponibilidade de presas.
Este estudo demonstra que a esponja *Spongilla lacustris* utiliza um sistema ancestral de sinalização monoaminérgica, envolvendo a síntese de monoaminas e a ativação de vias de sinalização celular, para coordenar a contração de seus canais de filtração sem a presença de neurônios ou músculos.
O artigo apresenta o TriMouNet, um algoritmo que infere redes filogenéticas de nível 1 a partir da distribuição de árvores gênicas multilocus para identificar reticulações com alta precisão, superando as limitações de métodos baseados em concatenação como o TriLoNet.
Este estudo demonstra que a seleção favorece a autofecundação dependente da condição, onde indivíduos em melhor estado genético se autofecundam e os em pior estado se cruzam, gerando variação dentro da população, reduzindo a carga de mutações e contribuindo para a manutenção de sistemas de acasalamento mistos.
Este estudo identifica as assinaturas transcricionais neurais e sensoriais que diferenciam a capacidade de aprendizado de preferência de acasalamento entre duas subespécies de *Heliconius melpomene*, sugerindo que a seleção sobre esses genes pode impulsionar o isolamento reprodutivo e a especiação.
Este estudo demonstra que, em vervetos selvagens, as diferenças sexuais nos traços de história de vida surgem principalmente através de investimentos maternos pós-natais que moldam trajetórias sociais divergentes, onde a idade da mãe influencia a proporção de sexos ao nascer e o seu status social afeta mais fortemente a sobrevivência e integração social das filhas do que a dos filhos.